報(bào)告題目：3D genome regulation in development and diseases

報(bào) 告 人：李 程  教 授

報(bào)告時(shí)間：2024年12月4日（星期三），上午9:30

報(bào)告地點(diǎn)：生科院1號(hào)樓109會(huì)議室

主辦單位：生命科學(xué)學(xué)院、江蘇省比較基因組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、江蘇省基因組學(xué)國(guó)際聯(lián)合研究中心、科學(xué)技術(shù)研究院

報(bào)告人簡(jiǎn)介：

　　李程教授/博士生導(dǎo)師，國(guó)家杰出青年科學(xué)基金獲得者，任職于北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，北京大學(xué)統(tǒng)計(jì)科學(xué)中心及北京大學(xué)生物信息中心。1995年本科畢業(yè)于北京師范大學(xué)數(shù)學(xué)系，2001年博士畢業(yè)于美國(guó)加州大學(xué)洛杉磯分校統(tǒng)計(jì)系。2002至2013年在哈佛大學(xué)生物統(tǒng)計(jì)系暨Dana-Farber 癌癥研究所先后擔(dān)任助理教授和副教授。2013年起在北京大學(xué)任職。現(xiàn)擔(dān)任中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)三維基因組學(xué)專(zhuān)委會(huì)、中國(guó)生物信息學(xué)基因組信息學(xué)專(zhuān)委會(huì)副主任委員。實(shí)驗(yàn)室使用和發(fā)展組學(xué)新技術(shù)，以研究大腦衰老和再生過(guò)程的機(jī)制和干預(yù)方法。采用高通量實(shí)驗(yàn)技術(shù)和計(jì)算方法相結(jié)合的手段，系統(tǒng)開(kāi)展了細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控的三維基因組與多組學(xué)研究。發(fā)現(xiàn)了加速干細(xì)胞重編程和治療難治性腫瘤的新靶點(diǎn)，為三維基因組學(xué)發(fā)展了新技術(shù)，為染色質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)參與細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控研究開(kāi)拓了新視角。研究組開(kāi)發(fā)的dChip（生物芯片分析）、ComBat（批次效應(yīng)矯正）等基因組數(shù)據(jù)分析算法和軟件被同行廣泛使用，發(fā)表學(xué)術(shù)論文150余篇，包括作為通訊作者發(fā)表在Cell、Cell Stem Cell、Cancer Cell、Nature Immunology的論文，谷歌學(xué)術(shù)累計(jì)引用48,000次，h-index為79。研究組獲得國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)杰出青年科學(xué)基金項(xiàng)目、基礎(chǔ)科學(xué)中心項(xiàng)目、科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃的資助。研究組介紹網(wǎng)頁(yè)：http://3d-genome.life/。

報(bào)告摘要：

　　三維基因組學(xué)是一個(gè)新興的表觀遺傳學(xué)研究方向，其研究重點(diǎn)在于理解基因組的空間組織結(jié)構(gòu)以及這種結(jié)構(gòu)如何影響基因表達(dá)和調(diào)控。在真核生物中，基因組不是以線(xiàn)性形式存在，而是以復(fù)雜的三維空間結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)。這種三維結(jié)構(gòu)主要由染色質(zhì)纖維通過(guò)各種相互作用形成，包括染色質(zhì)環(huán)、拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)域、AB區(qū)室、染色質(zhì)互作樞紐等。在本報(bào)告中，將首先介紹基于高通量測(cè)序的方法，如Hi-C，這些方法能夠提供高分辨率數(shù)據(jù)，在全基因組范圍揭示染色質(zhì)空間互作網(wǎng)絡(luò)和動(dòng)態(tài)。染色質(zhì)互作的異常變化與多種疾病相關(guān)，如癌癥、神經(jīng)退行性疾病等。因此，研究染色質(zhì)互作的機(jī)制和功能，有助于我們理解疾病的發(fā)病機(jī)制，并開(kāi)發(fā)出新的治療方法。